Ayrıca İzmit Körfezi’ne yapılması planlanan üç kilometre uzunluğundaki asma köprünün, zaten mevcut sanayi tesisleri yüzünden tehdit altında olan Körfez’in deniz ortamı üzerinde etkileri olacaktır. Köprünün ayakları için yapılan kazılarda ortaya çıkan çamurun nereye deşarj edileceği, zeminde yapılan bu kazıların deniz tabanı üzerindeki etkileri gibi konular son derece önemli.